Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT1Q9BQL6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT1Q9BQL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms