Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms