Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms