Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms