Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms