Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms