Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNF8Q96H20 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms