Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF0

MTMR8, Myotubularin-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR8Q96EF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MTMR8Q96EF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR8Q96EF0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms