Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COPS9Q8WXC6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS9Q8WXC6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS9Q8WXC6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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