Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFRP1Q8N474 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFRP1Q8N474 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms