Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms