Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM15Q7Z3B0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM15Q7Z3B0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms