Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFXL1Q6ZNB6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFXL1Q6ZNB6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms