Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCIMPQ6UWF3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms