Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFSP1Q6NVU6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms