Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ABLIM2Q6H8Q1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms