Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMYD5Q6GMV2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD5Q6GMV2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms