Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BROXQ5VW32 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms