Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms