Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms