Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC4Q5GLZ8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms