Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM259Q4ZIN3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms