Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms