Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2CQ496J9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2CQ496J9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms