Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms