Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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