Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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