Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA6Q15825 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA6Q15825 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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