Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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