Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SF1Q15637 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SF1Q15637 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SF1Q15637 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF1Q15637 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF1Q15637 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF1Q15637 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF1Q15637 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF1Q15637 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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