Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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