Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3CQ15386 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
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