Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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