Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO1Q147U7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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