Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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ERV3-1Q14264 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ERV3-1Q14264 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ERV3-1Q14264 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ERV3-1Q14264 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERV3-1Q14264 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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