Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
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