Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms