Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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SNTA1Q13424 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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