Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRJQ12913 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRJQ12913 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms