Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A2Q12908 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A2Q12908 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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