Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBQ06643 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBQ06643 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBQ06643 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBQ06643 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBQ06643 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBQ06643 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBQ06643 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBQ06643 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBQ06643 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBQ06643 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBQ06643 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBQ06643 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTBQ06643 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms