Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN12Q05209 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms