Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms