Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF17Q02223 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms