Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms