Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HPCAP84074 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPCAP84074 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPCAP84074 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPCAP84074 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPCAP84074 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPCAP84074 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPCAP84074 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPCAP84074 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPCAP84074 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms