Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPD1P62314 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPD1P62314 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms