Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms