Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP4BP1P59074 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms