Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP1P54849 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP1P54849 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP1P54849 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP1P54849 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EMP1P54849 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMP1P54849 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMP1P54849 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP1P54849 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP1P54849 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP1P54849 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP1P54849 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP1P54849 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms